腐植酸是动植物的遗存，主要是植物的遗存，是一种通过微生物分解转化、地球化学等一系列过程产生和积累的有机质。它的总数量惊人地庞大，以万亿吨计。而生物腐植酸有机肥能增加土壤养分。腐植酸通过吸附、络合、螯合、离子交换等途径，或通过激活或防止土壤酶间接富集养分，能保护和储存养分。
由于腐植酸广泛存在，对地球的影响很大，涉及碳循环、矿物迁移与积累、土壤肥力、生态平衡等。土壤中腐植酸总量大，但平均含量不到1%。咸水中总含量不小，但浓度较低。
使用了该肥，能提高肥料效率。氮、腐植酸能显著减少氮肥损失，提高氮肥利用率，具有硝化预防作用，延长氮肥供植物使用的时间。磷和腐植酸能预防土壤中磷的固定，延长土壤中磷的运动距离，延缓有效磷向延迟或无效磷的转化，提高磷肥的利用率和效率，增加作物吸收的磷量，防止不溶性磷。
呼吸和腐植酸的氧化还原特性可增强植物呼吸强度，为植物生命活动提供能量，为植物重要有机合成提供原料，提高植物病害免疫力。
生物腐植酸有机肥能促进脯氨酸的合成和某些酶的活性，维持细胞渗透压，减少细胞膜损伤，减少叶片气孔开放，降低蒸腾强度。
