复混专用有机肥和普通有机肥的区别主要在于它们的执行标准、登记管理部门和农田施用量。
执行标准：普通有机肥主要来源于植物和(或)动物，经过发酵腐熟的含碳有机物料，执行的是NY525-2012标准，要求N+P2O5+K2O≥5%、有机质≥45%。而复混专用有机肥是含有一定有机肥料的复混肥料，执行的是GB/T 18877-2009标准，Ⅰ型要求N+P2O5+K2O≥15%、有机质≥20%，Ⅱ型要求N+P2O5+K2O≥25%、有机质≥15%。
登记管理部门：普通有机肥和复混专用有机肥都需要在农业部门进行登记，但登记管理部门可能不同。
农田施用量：普通有机肥的亩施用量一般在500公斤以上，而复混专用有机肥的亩施用量则根据不同的类型有所不同，Ⅰ型不超过80公斤，Ⅱ型不超过120公斤。
总体来说，复混专用有机肥和普通有机肥在多个方面存在明显差异，使用时需要根据作物和土壤条件等因素进行合理选择。
